十七大以來，黨中央、國務院把環(huán)境保護擺上更加突出的位置，把建設資源節(jié)約型、環(huán)境友好型社會作為加快轉變經(jīng)濟發(fā)展方式的重要著力點。審計署為全面貫徹落實科學發(fā)展觀，進一步加大了資源環(huán)境審計工作力度，2008年將“資源環(huán)境審計”作為中國政府六大審計類型之一予以強化；2009年，審計署印發(fā)了《加強資源環(huán)境審計工作的意見》，進一步明確了今后資源環(huán)境審計工作的指導思想、主要任務、發(fā)展目標和具體舉措，要求各級審計機關充分認識資源環(huán)境審計的重要性和緊迫性，積極開展工作。
農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司最近幾年組織實施的資源環(huán)境審計項目，在促進國家資源環(huán)保政策的貫徹落實、維護國家財經(jīng)法紀、提高資金使用效益和效果、保障資源環(huán)境安全、督促地方政府積極履行職責加大資源管理和環(huán)境保護力度、促進轉變經(jīng)濟發(fā)展方式等方面發(fā)揮了積極作用，充分發(fā)揮了資源環(huán)境審計保障國家經(jīng)濟社會健康運行的“免疫系統(tǒng)”功能和推動國家治理作用。
一是嚴肅查處重大違法違規(guī)問題，保證國家資源環(huán)境專項資金管理使用安全和完整。農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司始終堅持以真實性、合法性審計為基礎，不斷加大查處重大違法違規(guī)和經(jīng)濟犯罪問題的力度，促進反腐倡廉建設，強化對權力的監(jiān)督與制約。嚴肅查處重大違法違規(guī)問題，并向有關部門移交了相關線索，責任人員被嚴肅處理或受到法律制裁。這些大案要案的查處，嚴肅了財經(jīng)法紀，起到了懲戒和警示作用，也保證了資源環(huán)境專項資金使用管理的安全和完整。
二是揭示資源節(jié)約利用和環(huán)境保護領域存在的突出問題，督促有關地方政府和部門嚴格執(zhí)行政策法規(guī)，提高資源環(huán)境管理水平。農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司注重對國家資源環(huán)境政策和措施貫徹落實情況進行審計，促使地方政府及有關部門或單位認真執(zhí)行政策法規(guī)，提高國家有關政策法規(guī)的執(zhí)行效果和管理水平。如在2010年黃河流域水污染防治與水資源保護審計調(diào)查中，審計反映了黃河流域河道被亂占的問題。審計結果公告后，中央電視臺《焦點訪談》和《新聞調(diào)查》欄目對公告反映的24個建設項目違規(guī)占用河道的問題以“被蠶食的母親河”為專題進行了跟蹤報道。水利部及黃河水利委員會先后成立10個調(diào)查組赴各地督促整改。目前，據(jù)水利部的整改報告反映，22個項目已完成整改并通過驗收，2個項目在整改中。在審計的大力推動和水利部門的重拳整改以及中央媒體的輿論監(jiān)督共同作用下，黃河流域亂占河道的行為得到初步遏制，特別是“河道不侵占”被黃河水利委員會正式列入今后黃河治理的五大目標之一。
三是完善資源管理和環(huán)境保護的體制、機制和制度建設，為制定和完善資源環(huán)境保護政策法規(guī)提供參考依據(jù)，維護國家資源環(huán)境安全。農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司注重從體制、機制、制度層面發(fā)現(xiàn)和分析研究問題，提出審計意見和建議，維護我國資源環(huán)境安全。在近年組織實施的資源環(huán)境審計項目中，向國務院和有關部委報送了91篇審計報告和信息。這些報告和重要審計信息大部分得到國家領導人的重要批示，也引起了主管部門的高度重視，成為制定和調(diào)整相關政策的重要依據(jù)和參考，據(jù)此出臺、修改、完善多項資源環(huán)境管理方面的政策法規(guī)。如在2009年開展的礦產(chǎn)資源專項審計調(diào)查中，組織上報了有關稀土資源開發(fā)利用的信息，多位國家領導人做了批示，工業(yè)和信息化部、發(fā)展改革委等12個部委貫徹落實國務院領導對稀土信息批示的要求，出臺了控制總量、調(diào)整指標、強化出口配額管理等一系列制度措施，增強了我國稀土產(chǎn)業(yè)在國際市場的競爭力和話語權，為我國稀有礦產(chǎn)資源的保護、開發(fā)和利用發(fā)揮了重要作用。
面對經(jīng)濟發(fā)展和環(huán)境保護的新形勢，資源環(huán)境審計進入了全新的發(fā)展時期，既面臨新的發(fā)展機遇，也面臨一些挑戰(zhàn)和困難。農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計司將進一步加強對科學審計理念的學習，認真領會精神實質(zhì)，深入研究我國資源環(huán)境工作的形勢和任務，扎實推進資源環(huán)境審計工作，更好發(fā)揮資源環(huán)境審計保障國家經(jīng)濟社會健康運行的“免疫系統(tǒng)”功能。
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